la molécula de ADN
ejercicios

Cuestiones para el examen (2006)

1 . ¿ Lo que es un nucleotida monofosfata?
2 . ¿ Que son los enlaces ester, diester?
3 . ¿ Cuánto hay puentes hidrógenos entre A y T y entra G y C?
4a. ¿ Lo que es un nick, un gap?
4b. ¿ Definir la nick "traslación"?
5a. ¿ Cual es la diferencia entre la fusión y la desnaturalización del ADN?
5b. ¿ La desnaturalización del ADN es reversible?
5c. ¿ Conoce a una técnica que utiliza la desnaturalización?
5d. ¿ Que significa la sigla Tm?
6a. Definir "hibridación".
6b. ¿ Podemos formar híbridos no naturales? ¿ Tienen un interés?
6c. ¿ Qué es una "sonda" ?
7 . ¿ Qué es la polinucleótido quinasa?
8a. definir "un agente que intercala"
8b. ¿ Cuál es el peligro de los agentes intercalas?
8c. Cite a dos agentes intercalas.
9a. ¿Los plásmidos son indispensables y cual es su interés?
9b. ¿ Para qué sirven el teloméros?
9c. ¿ Cómo purificamos el ADN?
9d. ¿ El ADN es frágil?
10. ¿ Describa La electroforésis en campo pulsátil (o PFGE)?
12a. ¿ Cómo el ADN lo es empaquetado en el núcleo de los eucarióticos?
12b. ¿ Por qué decimos que en los eucarióticos hay una separación física entre la traducción y la transcripción?
12c. ¿ Dónde encontramos y para qué sirve las protaminas?

ADN Pol

Cuestiones para el examen

1. Definir una ADN pol.
2. ¿ Los ADN Pols añaden los nucléotidos a la misma velocidad?
3. ¿ Qué un ddNTP?
4. ¿ Por qué se modifica la talla del sitio catalítica del ADN pol?
5. ¿ Cuál es la talla mínima de un cebador?
6. ¿ Cuál es la función del primasa?

7. ¿ Describa las actividades catalíticas del ADN pol?
8. ¿ Cuál actividad se supriman en ADN pol que sirven para la secunciaciòn y por qué?
9. Describir la " nick traslación".
10. ¿ Cuál es la función del ADN polymérase I?
11. ¿ Conoce a inhibidores del ADN pol.
12. ¿ Por qué la actividad endonucleasica 5 '---> 3 ' es utilizada en PCR en tiempo real?

enzimas de restricción

Cuestiones para el examen

1. Definir una enzima de restricción.
2. ¿ Que hace una enzima de restricción ?
3. Describa las enzimas de restrction de tipo II.
4. Describa las enzimas de restrction de tipo III.
5. ¿ A partir de cuáles organismos se aislan enzimas de restricción ?
6. ¿ Que significa la palabra metiltransferasa?
7. Definir " una unidad " para las enzimas de restricción.


8. Definir un isoschizomeros para una enzima de restricción.
9. Definir cortes pegajosos, salientes o cohesivos.
10. Definir palíndromo.
11. ¿ Que significa Eco RI?
12. ¿ Qué una carta de restricción?
13. Describir una hidrólisis de restricción en práctica.
14. ¿ Cómo se determina la talla media fragmentos de retriction?
15. Definir un RFLP¿

plásmido
Cuestiones para el examen

1. ¿ Qué es un plásmido, un episomo ?
2. ¿ Son los plásmidos dependientes del cromosoma bacteriano para sus reproducción?
3. definir "Transformar una bacteria ó una levadura"
4. ¿ Que quiere decir la palabra "transformar" para las células eucarióticas, salvo las levaduras?.
5. ¿ Cuáles son los métodos utilizados para transformar las bacterias?
6. ¿ Quese llama replicón, origen de replicación?
7. ¿ Que es un plasmide recombinado?
8. ¿ Que es que marcador de selección?
9. ¿ Cuál es el interés de colocar un gen en LacZ?
10. Definir " polilinker".
11. Definir la clonación direccional.
12. ¿ A qué sirve la defosforilación?
13. ¿ Cuál es el difference entre los plásmidos de las bacterias y los utilizados para las células de mamíferos?
14. ¿ Qué es la proteína fluorescete verde (GFP)?
15. ¿ Cómo funcionan los plásmidos reporteros?
16. ¿ Cuáles vectores debemos construir par transfectar T. cruzi?
17. ¿ Hay plásmidos en Entamoeba histolytica y a quién codifican?
18. Describa algunas funciones cumplidas por plasmides.

PCR
ejercicios


Cuestiones para el examen:

1. definir "cebador".
2. Explicar la palabra annealing
3. ¿ Cual es la extremidad del cébador que es alargada por la DNA pol?
4. Describa las 4 etapas de cada ciclo de la PCR
5. ¿ Cuáles son las diferencias entre la amplificación aritmética y geométrica?
6. ¿ Qué es una PCR "in silico"?
7. ¿ Cuáles son las diferencias entre la Taq polimerasa y la Pfu ADN
polymerasa?
8. ¿ La temperatura de hibridación de los cebadores depende de la concentración en sal?
9. ¿ Cómo detectar rápidamente una contaminación en la PCR?
10. ¿ Cómo limpiar una pipeta contaminada?
11 ¿ Cómo calcular la temperatura de "annealing"?
12. Explicar la nested PCR.
13. ¿ Es posible clonar los productos de PCR?
14. ¿ Cómo se sintetizan los cebadores?
15. Describir las figuras del primer articulo sobre la PCR (1985)
16; ¿ Cómo se determina la duración de las fases en la PCR?
17. ¿ Cómo se determina la temperatura ideal de anneling?
18. ¿ Cuando los ciclos de la PCR se terminan, es aconsejable de mantener el termociclador a 4°C?
19. ¿ Cómo se diluyen los cebadores?
20. ¿ A que velocidad trabaja laTaq ADN pol?
21. ¿ Cómo escoger y analizar un par de cebadores que puedan detectar KERP1.
22. Definir "hot start" y describir un método simple para realizarlo.
23. ¿ Cuáles son los problemas de nuestro hot start, "el hot start del pobre", y cómo se señala esto?

PCR-cinetic
Cuestiones para el examen:

1. ¿ Cuáles son las tres fases de la PCR?
2. ¿ Por qué hay una línea de base?
3. ¿ En cuántas partes se divida la fase ascendiente y por qué?
4. ¿ Cómo se verifica el rendimiento de la PCR?

 

5. ¿ Es fácil medir el rendimiento del RT-PCR, por qué?
6. Discutir la utilización de los controles internos.
7. Explique las figuras 2, 4 y 5.
8. Los plásmidos de Entamoeba histolytica codifican el ARN de la pequeña subunit del ribosome. En los quistes de E. histolytica hay 4 núcleos. ¿ Es posible por la PCR de contar el número de plásmidos en una célula de Entamoeba?


Expression en E.coli

Cuestiones para el examen

1. Definir la transcripción.
2. ¿ Cuál es el azúcar y la basa específicos del ARN?
3. ¿ Con cuál base se aparea el uralcilo?
4. ¿ Que abastece la hidrólisis del PPi?
5. ¿ A qué sirve un promotor?
6. Definir la palabra opéron.
7. ¿ Cual diferencia hay entre operon y policistron?
8. ¿ Que es que X-gal?
9. ¿ Que es que lacZ?
10.¿ Que es que IPTG?
11. Définir: operon y repressor.
12. describir el opéron lactose.

13. ¿ Cuál es la proteína codificada por el gen i en casa de E coli?
14. ¿ Cómo la ARN pol de E. coli hace para fijarse sobre su promotor?
15. ¿ Que es que la caja de Pribnow?
16.¿ Que es que un terminador?
17. ¿ Cómo se acaba la transcripción?
18. ¿ Que es que la secuencia de Shine-Delgarno?
19. ¿ Queremos exprimir un gen de mamífero en E. coli, cuáles son los problemas puestos?
20. ¿ Que es que una proteína de fusión?
21. ¿ Podemos producir proteínas nativas en casa de E. coli?
22. ¿ Lo que es lo que una etiqueta histidina?
23. Describa la síntesis de la insulina por E. coli.